Agronomická fakulta - seznam publikacíHelp


V následujícím souhrnu jsou uvedeny veškeré informace evidované k publikaci.

ŠMERKOVÁ, K. -- RÝPAR, T. -- ADAM, V. -- VACULOVIČOVÁ, M. Direct Magnetic Bead-Based Extraction of MicroRNA from Urine with Capillary Electrophoretic Analysis Using Fluorescence Detection and Universal Label. Journal of Biomedical Nanotechnology. 2020. sv. 16, č. 1, s. 76--84. ISSN 1550-7033. URL: https://doi.org/10.1166/jbn.2020.2872

Originální název:
Direct Magnetic Bead-Based Extraction of MicroRNA from Urine with Capillary Electrophoretic Analysis Using Fluorescence Detection and Universal Label
Český název:
Autor:
Pracoviště: Ústav chemie a biochemie
Druh publikace:
článek v odborném periodiku
Periodikum: Journal of Biomedical Nanotechnology
Charakter článku:
odborný článek
Číslo svazku (ročník): 16
Číslo periodika v rámci svazku:
1
Rok vydání:
2020
Od strany:
76
Do strany:
84
Počet stran:
9
Poddruh:
článek je obsažen v databázi Web of Science
Kód UT dle Web of Science:
Kód EID dle Scopus:
Forma vydání:
tištěná verze (print)
Původní jazyk:
angličtina
Popis v originálním jazyce: Short non-coding RNAs, specifically microRNAs (miRNAs), are of a great interest due to their presumed function in genome regulation. Moreover, miRNAs are currently perceived as potential biomarkers for numerous diseases; a variety of detection methods and sensing systems have therefore been studied. We present a magnetic-bead-based assay for specific miRNA isolation coupled with sensitive electrophoretic analysis with fluorescence detection. The magnetic separation step involves creating a duplex with targeted miR-141, which is subsequently cleaved from the magnetic bead surface with a specific endonuclease. The duplex is then determined using capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence detection in the presence of the fluorescent dye PicoGreen for quantitating double-stranded DNA. The benefits of using microcolumn separation technique coupled with sensitive detection over traditionally used determination by fluorescence spectrometry include the fact that there is no need for a specific pre-labeled fluorescent probe. This significantly simplifies the method and reduces the costs. Cross-reactivity with mismatched oligonucleotides (3 and 5 mismatched bases) and different miRNAs (miR-124 and miR-150) was tested, demonstrating the specificity of the developed method for miRNA-141. This magnetic extraction method was demonstrated for the direct isolation and determination of miR-141 at different concentration levels from urine samples and the achieved nanomolar detection limit.
Popis v anglickém jazyce:
Popis v českém jazyce:
Rok uplatnění:
2020
Rok odeslání:
Identifikační číslo RIV:
URL:
https://doi.org/10.1166/jbn.2020.2872
 
Záznam vložil:
Markéta Hejčová, DiS.
Poslední změna:
14.02.2020 10:11 (Markéta Hejčová, DiS.)

Hodnocení publikace:

12
3
45
        
12
3
4
5
špatné
 
dobré        
nezajímavé
 
zajímavé
Hodnotilo: 0Průměr: -        Hodnotilo: 0Průměr: -
12
3
4
5
        
1
2
3
4
5
laické
 
odborné
        
teoretické
 
praktické
Hodnotilo: 0
Průměr: -        
Hodnotilo: 0
Průměr: -


Bližší určení zdroje:

Journal of Biomedical Nanotechnology. Valencia: ISSN 1550-7033.

Originální název:
Journal of Biomedical Nanotechnology
Český název:
Autor:
Druh publikace:
časopis
ISSN: 1550-7033
Stát vydavatele: Spojené státy americké
Místo vydání:
Valencia
Vydavatel:
American Scientific Publishers
URL:
Recenzovaný časopis:
ne
Původní jazyk: angličtina
Popis v originálním jazyce:
Popis v anglickém jazyce:
Popis v českém jazyce:
 
Záznam vložil:
Poslední změna: 08.11.2017 14:46 (Šárka Novotná)

Hodnocení publikace:

1
2
3
4
5
        
12
3
4
5
špatné
 
dobré
        nezajímavé
 
zajímavé
Hodnotilo: 0Průměr: -
        
Hodnotilo: 0
Průměr: -
1
2
34
5
        
1
2
3
4
5
laické
 
odborné
        
teoretické
 
praktické
Hodnotilo: 0
Průměr: -
        
Hodnotilo: 0
Průměr: -