| zamítnutý | 1 | DNA mikrosatelitní analýzy genetické diverzity v uzavřených populacích a management chovu Elaphurus davidianus. | M. Ernst | GAČR | garant | 01.01.2008 | 31.12.2010 |
| řešený | 2 | Ekologie, reprodukce a zdravotní stav prasete divokého jako základ jeho managementu | J. Kamler | IGA | řešitel | 01.02.2016 | 31.01.2019 |
| zrušený | 3 | Genetická variabilita a diverzita a určení věku zajíce polního (Lepus europaeus) ve vybraných lokalitách ČR | M. Ernst | Jiný | garant | 01.12.2009 | 02.12.2009 |
| obhájený | 4 | Inovace laboratorních cvičení o metody molekulární genetiky | M. Ernst | FRVŠ | garant | 01.03.2003 | 31.12.2003 |
| zamítnutý | 5 | Inovace studijního předmětu "Aplikovaná molekulární genetika" rozšířením praktických laboratorních cvičení | M. Ernst | FRVŠ | garant | 03.05.2011 | 01.07.2011 |
| ukončený | 6 | Laboratoř výuky molekulární biologie v lesnických disciplínách. | M. Ernst | RP | garant | 01.01.2010 | 30.10.2010 |
| řešený | 7 | Optimalizace chovu extralimitní populace kozy bezoárové v oboře Vřísek | M. Ernst | GS LČR | garant | 15.01.2016 | 31.12.2019 |
| obhájený | 8 | Podpora druhové rozmanitosti v katastru Němčice nad Hanou -- zvýšení početnosti a genetické variability místní populace koroptve polní | M. Ernst | Jiný | garant | 01.07.2012 | 31.12.2012 |
| obhájený | 9 | Rozšíření diplomové práce o gen leptinu (LEP) u populací Sus scrofa na území České republiky | M. Ernst | FRVŠ | garant | 01.03.2003 | 31.12.2003 |
| obhájený | 10 | Rozšíření Ph.D. disertační práce o geny ESR, FSHB, PRLR a HFABP k identifikaci distančních rozdílů populací divokých a chovných prasat | M. Ernst | FRVŠ | garant | 01.03.2002 | 31.12.2002 |
| ukončený | 11 | Variabilita genu Melanocortin-1 Receptor (MC1R) jako nástroj pro zjišťování hybridů mezi divokými prasaty (Sus scrofa scrofa) a domácími prasaty (Sus scrofa f. domestica), za použití metody PCR-RFLP. | M. Ernst | IGA | garant | 15.03.2016 | 31.12.2016 |
| řešený | 12 | Vytvoření genetické databanky vybraných druhů savců ČR k využití pro udržitelný rozvoj dopravy | M. Ernst | TAČR | garant | 01.01.2013 | 31.12.2015 |
| obhájený | 13 | Vytvoření genetické databanky vybraných druhů savců ČR k využití pro udržitelný rozvoj dopravy | M. Ernst | TAČR | hlavní řešitel | 01.01.2012 | 31.12.2015 |
| zamítnutý | 14 | Využití kombinace molekulárně genetických a kraniometrických metod při determinaci jelena lesního a jelena siky. | M. Ernst | GAČR | garant | 01.01.2007 | 31.12.2009 |
| obhájený | 15 | Využití metod molekulární genetiky při mapování populací bobra evropského (Castor fiber, L.) na zájmových územích v České republice. | M. Ernst | IGA | garant | 01.01.2007 | 31.12.2007 |
| obhájený | 16 | Využití mikrosatelitních analýz při monitoringu populace a přeshraniční migrace losa evropského v oblasti LS Vyšší Brod | M. Ernst | GS LČR | garant | 01.09.2008 | 27.10.2011 |
| obhájený | 17 | Využití mikrosatelitních analýz při šlechtění populace kozy bezoárové v oboře Žižkův vrch na LS Česká Lípa | M. Ernst | GS LČR | garant | 01.01.2008 | 31.01.2011 |
| obhájený | 18 | Využití molekulárně genetických metod při šlechtění populace bílých jelenů u LČR, s.p. | M. Ernst | GS LČR | garant | 01.08.2004 | 15.11.2006 |